Według zaleceń Dobrej Praktyki Ochrony Roślin wyposażenie magazynu powinno spełniać następujące warunki:
- sztuczne oświetlenie,
- grawitacyjna oraz wymuszona wentylacja zapobiegająca gromadzeniu się toksycznych oparów środków chemicznych, uruchamiana przed wejściem do magazynku,
- gazo- i pyłoszczelna instalacja elektryczna,
- gaśnica,
- ręcznik papierowy,
- miejsce do przechowywania:
- środków toksycznych i bardzo toksycznych (zamykany na klucz boks lub przewiewna szafka metalowa),
- preparatów niepełnowartościowych i w cieknących opakowaniach,
- skażonych materiałów użytych w sytuacjach awaryjnych,
- opakowań po użytych środkach ochrony roślin,
- narzędzi do neutralizacji rozlanych lub rozsypanych preparatów (łopata, szczotka, wiadro i pojemnik z sorbentem),
- półki na chemikalia z materiału nienasiąkliwego, pozbawione ostrych krawędzi i elementów mogących uszkadzać opakowania,
- obiekt powinien być wyposażony w urządzenia zapobiegające zanieczyszczeniu lub skażeniu w stopniu szkodliwym powietrza, gruntu oraz wód substancjami chemicznymi (np. wanny wychwytowe).
Magazyn powinien być wyposażony w odpowiedni system wentylacji:
- awaryjnej – uruchamiany z zewnątrz i od wewnątrz magazynu, zapewniający co najmniej 10-krotną wymianę powietrza w ciągu godziny;
- ciągłej – uruchamiany z zewnątrz magazynu, godzinę przed rozpoczęciem pracy, zapewniający co najmniej 3-krotną wymianę powietrza w ciągu godziny.